Efter den förödande katastrofen som HYDRA orsakade i Washington D.C. står The Avengers inför en tuff utmaning. De har tagit över beskyddarrollen, och problemen bara ökar. Tony Stark vill göra allt för att förhindra några katastrofer i världen, och skapar därför en artificiell intelligens som ska stoppa hoten mot världen, men det man önskar kanske inte alltid är det man får. Kommer Avengers klara utmaningarna som ligger framför dem, eller kommer de att splittras?